Sistematskim merenjima koja vrše nadležne gradske institucije za kontrolu kvaliteta životne sredine obuhvaćeno je praćenje osnovnih zagađujućih materija, na unapred propisanim mernim mestima. U ovu grupu spadaju toksične, kancerogene i mutagene supstance, kao što su pesticidi, polihlorovani bifenili, dioksini, poliaromatični ugljovodonici. Vrlo često njihovo prisustvo u vodi, vazduhu, tlu, hrani, sedimentima ostaje nedetektovano. Na teritoriji grada Niša, u nadležnim gradskim institucijama, prati se stanje kvaliteta vode i vazduha. Kvalitet tla, kako površinskog horizonta, tako i njegovih dubljih slojeva se ne proučava dovoljno. Takođe, praćenje ovih polutanata u rečnim sedimentima, ihtiofauni, namirnicama lokalnog porekla, nije obuhvaćeno standardnim analizama. Razvojem HEC-a omogućena je primena najnovijih metoda hemijske analize u cilju
detektovanja do sada neispitivanih polutanata, u uzorcima koji ne ulaze u standardne metode ekološke kontrole. Hemijsko-ekološki centar primenjuje nove metode hemijske analize (nove i u okvirima EU), kojima se prati prisustvo zagađivača na teritoriji grada Niša. Ispitivanjima u HEC-u pored standardnih parametara kvaliteta životne sredine
prati se sledeće:
• pesticidi u vodi, zemljištu i namirnicama lokalnog porekla,
• metali u vodi, vazduhu i tlu. HEC na osnovu rezultata hemijskih analiza:
• definiše „crne“ tačke na teritoriji grada Niša,
• vršiti procenu izloženosti populacije,
• ukazuje na mogućnost preduzimanja odgovarajućih preventivnih mera nadležnim
institucijama i
• informiše javnost o svim navedenim aktivnostima.